Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDC1Q96MU7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms