Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC17Q96LX7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms