Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms