Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms