Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIC2Q96JB3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIC2Q96JB3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms