Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms