Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms