Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCTD12Q96CX2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms