Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APH1AQ96BI3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms