Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UTP4Q969X6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms