Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms