Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA1Q92743 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA1Q92743 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms