Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms