Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms