Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRSK1Q8TDC3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms