Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG16L2Q8NAA4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms