Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00612Q8N6U2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms