Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms