Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPRMLQ8N4K4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms