Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTROBQ8N137 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms