Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RAB11FIP4Q86YS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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RAB11FIP4Q86YS3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB11FIP4Q86YS3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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