Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASSF3Q86WH2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms