Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms