Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM72Q6ZMU5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms