Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSTM1Q6UX27 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms