Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REEP3Q6NUK4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms