Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms