Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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