Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms