Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms