Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIK1Q3SY52 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms