Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms