Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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