Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMA3Q16787 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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