Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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