Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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