Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA2Q15822 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms