Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIX1Q15475 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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