Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RAB35Q15286 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB35Q15286 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB35Q15286 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB35Q15286 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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