Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TNIP1Q15025 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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