Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLCA4Q14CN2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms