Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC3Q14003 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms