Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PKP1Q13835 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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