Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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APOFQ13790 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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APOFQ13790 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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APOFQ13790 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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APOFQ13790 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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APOFQ13790 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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