Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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