Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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