Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms