Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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