Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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