Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP140Q13342 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP140Q13342 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP140Q13342 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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